据媒体报道，菲律宾转基因茄子实地实验遭到Mindanao市长的反对而中止，根据市长发布的废除令，于12月拔出了由菲律宾大学种植的1500株转基因茄子。遭到废除的主要原因是菲律宾大学在进行实地实验之前没有与当地进行磋商，并且市长也怀疑他们在进行试验时，不能进行有效隔离，来确保生物安全性。
但是菲律宾大学坚持认为它们的实验遵守了所有相关要求，并没有对生物安全性和公众健康产生影响，唯一的行政过失是他们在进行实验之前没有发布公众信息表(PIS)，信息表是由本国的生物安全学会委员会发布的，菲律宾大学还提议开设公众论坛，来对公众进行告知和沟通，却也遭到了市长的拒绝。
菲律宾大学一再强调，他们的实验不是在开放区域进行的，而是经过了严格的隔离，所有的实验条件均符合规定，并且是按照规划进行的。此外，所实验的植物并不会和其它植物之间产生交叉授粉，因为茄子是自授粉作物，它们进行实验时，还设置花粉采集器以及200米的隔离距离。
市长要求，菲律宾大学必须按照程序与当地官方进行磋商后才能重新展开种植实验，菲律宾已经于去年批准了种植转基因茄子（参考：
菲律宾成为亚洲批准转基因茄子首例），计划在实地试验之后，于2012年正式开始商业化种植。
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