这也许违反常理，但是在美国，一些按照有机种植标准的作物上仍旧施用了商用农药产品。根据美国农业部的调查，20%的有机莴苣的农药检测结果呈阳性，大多含有一种叫做多杀菌素（陶氏名下的Entrust）的农药。
但是相关专家表示，有机种植并不是完全不使用农药，只是会较少施用高危险性的农药，并且会施用一些经过批准的农药产品，主要是一些被认为是天然源的农药，比如多杀菌素，它起源于一种土壤细菌，能破坏害虫的神经系统，导致其死亡，对软体动物也有毒性。
包括源自菊花的除虫菊酯，从印度尼姆树中得来的印楝素，以及上述提及到的多杀菌素，均被美国EPA确认为轻毒性物质被认可用于有机种植，一些包括铜类和硫在内的矿物和自然元素的化合物，如果确认没有毒性也可用于有机种植，部分天热产物，如砷，尼古丁等物质也不受限制。
虽然有机作物的用药相当严格，但是并不能说使用有机农药就会比常规农药安全，因为其中涉及到用量的关系，比方说要控制同样面积中的火疫病，使用少量常规农药就可以达到防控效果，并能同时确保安全性，但是如果使用有机农药的话，用量有可能会大很多，所以有机农药和常规农药之间的利弊也并不是那么容易权衡。
根据农业部的调查，在有机莴苣上，多杀菌素的含量甚至是常规的水果和蔬菜中的10倍。因此一些被认为相当严格的有机种植规范看上去也并不会给人带来多少安全感，常规食品和有机食品相比，更让用户觉得放心的是施用了一次农达的食品，而不是一直在没完没了地施用”有机农药”的有机食品。
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