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我国3000份超级稻基因组数据向全球免费开放

2015-09-18
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 世界农化网中文网报道:近日,中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙共同启动“云之稻项目”,并将正式通过阿里云平台,向全球免费开放3000份水稻核心种质基因组测序数据。
 
3000份水稻核心种质基因组测序数据,是科技部和比尔•梅琳达盖茨基金会“为非洲和亚洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻”重大科技专项的重要课题成果,这也是迄今为止全世界最大的植物基因组测序项目。项目旨在培育能够广泛适用于灌溉等地区的生态环境,并具氮磷高效利用、抗病、抗虫、高产、优质、抗逆(干旱、盐碱)等特性的水稻新品种,在目标国示范推广,推动杂交稻种子生产能力,并为撒哈拉以南非洲国家、亚洲和中国的西南地区水稻分子育种建立一个高效水稻基因型分析技术平台。
 
为水稻核心种质做基因组测序,是一项庞大工程。中国农科院农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程首席科学家黎志康领衔的团队,耗费了两年半的时间,才获得这3000份水稻核心种质基因组测序数据。业内专家表示,该基因数据库资源,至少有两方面用途,一是从基因库调取数据,研究目标基因的分布、进化和功能。二是可分析基因组之间的多态性位点,并以之开发分子标记,甚至是基因芯片,用于分子育种。
 
水稻基因数据公益云平台构建于阿里云的对象存储服务和批量计算服务之上。用户在云之稻(http://www.RiceCloud.org)下载数据,可直接在云端对3000份水稻核心种质基因组数据进行分析挖掘。项目目前已经对用户免费开放,后期还将陆续推出新的分析工具,方便科研工作者深入分析水稻基因组数据。
 
黎志康表示,“后基因组时代,这个项目还将结合功能基因组学新的方法和策略进行生物育种,贡献于粮食安全和食品健康的发展。希望全球水稻研究同行,能充分利用这一平台,也希望国家有关部门能给予关注和扶持,促进生物大数据行业的快速发展。”


本文编辑整理自中国生物技术信息网 

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Zhejiang Tide Crop Science Co.,Ltd.
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